LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN
Modelado molecular de compuestos con actividad biológica
Objetivos
- Encontrar nuevos compuestos líder para posterior optimización
- Identificar compuestos selectivos (chemical probes).
- Optimizar actividad biológica de compuestos activos
Métodos
- Acoplamiento molecular automatizado (docking)
- Cribado virtual (virtual screening)
- Modelado del farmacóforo
- Blancos terapéuticos representativo
- Dianas epigenéticas; DNA metiltransferasas
- Transcriptasa reversa VIH
Relaciones: estructura-actividad, estructura-múltiple actividad (SAR, SmAR)
Objetivos
- Optimizar actividad biológica de compuestos activos
- Desarrollar métodos para análisis cuantitativo y visual del SAR
- Análisis SAR de series de compuestos
- Identificar activity cliffs en forma sistemática
Métodos
- Panoramas de actividad (activity landscape modeling)
- Quimionformática
- QSAR
Quimiogenómica computacional y reposicionamiento de fármacos
Objetivos
- Identificar compuestos activos en bases de datos moleculares
- Encontrar blancos moleculares para compuestos activos
- Proponer usos terapéuticos alternos a fármacos aprobados
Métodos
- Cribado virtual (virtual screening)
- Búsqueda de blancos moleculares (target fishing)
- Quimionformática
- Similitud molecular
Análisis quimioinformático de bases de datos moleculares
Objetivos
- Obtener perfil de bibliotecas moleculares
- Propiedades fisicoquímicas
- Diversidad estructural
- Distribución en el espacio químico
Bibliotecas analizadas a la fecha
- Productos naturales (bibliotecas públicas)
- Fármacos aprobados y compuestos obtenidos por síntesis
Métodos
- Visualización del espacio químico
- Quimionformática
- Minería de datos
- Similitud molecular
