LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN


Modelado molecular de compuestos con actividad biológica

Objetivos

  • Encontrar nuevos compuestos líder para posterior optimización
  • Identificar compuestos selectivos (chemical probes).
  • Optimizar actividad biológica de compuestos activos

Métodos

  • Acoplamiento molecular automatizado (docking)
  • Cribado virtual (virtual screening)
  • Modelado del farmacóforo
  • Blancos terapéuticos representativo
  • Dianas epigenéticas; DNA metiltransferasas
  • Transcriptasa reversa VIH

Relaciones: estructura-actividad, estructura-múltiple actividad (SAR, SmAR)

 Objetivos

  • Optimizar actividad biológica de compuestos activos
  • Desarrollar métodos para análisis cuantitativo y visual del SAR
  • Análisis SAR de series de compuestos
  • Identificar activity cliffs en forma sistemática

Métodos

  • Panoramas de actividad (activity landscape modeling)
  • Quimionformática
  • QSAR

Quimiogenómica computacional y reposicionamiento de fármacos

 Objetivos

  • Identificar compuestos activos en bases de datos moleculares
  • Encontrar blancos moleculares para compuestos activos
  • Proponer usos terapéuticos alternos a fármacos aprobados

Métodos

  • Cribado virtual (virtual screening)
  • Búsqueda de blancos moleculares (target fishing)
  • Quimionformática
  • Similitud molecular

Análisis quimioinformático de bases de datos moleculares

Objetivos

  • Obtener perfil de bibliotecas moleculares
  • Propiedades fisicoquímicas
  • Diversidad estructural
  • Distribución en el espacio químico

Bibliotecas analizadas a la fecha

  • Productos naturales (bibliotecas públicas)
  • Fármacos aprobados y compuestos obtenidos por síntesis

Métodos

  • Visualización del espacio químico
  • Quimionformática
  • Minería de datos
  • Similitud molecular