LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN - difacquim

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN

Modelado molecular de compuestos con actividad biológica

Objetivos

Encontrar nuevos compuestos líder para posterior optimización
Identificar compuestos selectivos (chemical probes).
Optimizar actividad biológica de compuestos activos

Métodos

Acoplamiento molecular automatizado (docking)
Cribado virtual (virtual screening)
Modelado del farmacóforo
Blancos terapéuticos representativo
Dianas epigenéticas; DNA metiltransferasas
Transcriptasa reversa VIH

Relaciones: estructura-actividad, estructura-múltiple actividad (SAR, SmAR)

Objetivos

Optimizar actividad biológica de compuestos activos
Desarrollar métodos para análisis cuantitativo y visual del SAR
Análisis SAR de series de compuestos
Identificar activity cliffs en forma sistemática

Métodos

Panoramas de actividad (activity landscape modeling)
Quimionformática
QSAR

Quimiogenómica computacional y reposicionamiento de fármacos

Objetivos

Identificar compuestos activos en bases de datos moleculares
Encontrar blancos moleculares para compuestos activos
Proponer usos terapéuticos alternos a fármacos aprobados

Métodos

Cribado virtual (virtual screening)
Búsqueda de blancos moleculares (target fishing)
Quimionformática
Similitud molecular

Análisis quimioinformático de bases de datos moleculares

Objetivos

Obtener perfil de bibliotecas moleculares
Propiedades fisicoquímicas
Diversidad estructural
Distribución en el espacio químico

Bibliotecas analizadas a la fecha

Productos naturales (bibliotecas públicas)
Fármacos aprobados y compuestos obtenidos por síntesis

Métodos

Visualización del espacio químico
Quimionformática
Minería de datos
Similitud molecular